Zur Bearbeitung von Sonderaufgaben mit besonderer fachlicher Zielsetzung kann der Gesamtvorstand Arbeitskreise benennen. Die Anerkennung beschließt die Hauptversammlung. Die Aufgaben eines Arbeitskreises werden vom Geschäftsführenden Vorstand, gegebenenfalls im Einvernehmen mit dem Gesamtvorstand, festgelegt. Die Arbeitskreise können sich mit Zustimmung des Geschäftsführenden Vorstandes eigene Aufgaben stellen.
Derzeit sind fünf Arbeitskreise im Hartmannbund aktiv tätig:
Arbeitskreis I – Ambulante Versorgung
Arbeitskreis II – Stationäre Versorgung
Arbeitskreis III – Gesundheitsdienste
Arbeitskreis IV – Aus- und Weiterbildung
Arbeitskreis V – Junge Ärztinnen und Ärzte